Акции!

Специальное предложение по стоимости на лор-оборудование

Новости

Современные методы диагностики – надежда и опора врача

16-05-2017

Современные методы диагностики – надежда и опора врача Всего лишь...

Красота для богачей – самые дорогие салонные процедуры

30-04-2017

Комплексный уход за телом с применением самых инновационных средств и...

Креатив зашкаливает – самые необычные больницы в мире

16-04-2017

Больницы у большинства людей ассоциируются с чем-то малоприятным...

Польза ванны с морской солью

31-03-2017

Еще в незапамятные времена в медицинских кругах существовало выражение о...

Секреты массажа – профессиональный стол в помощь

16-03-2017

Человечество придумало множество способов, как оздоровить, исцелить тело и поднять...

Медицинская мебель – подбираем больничное хозяйство

01-03-2017

Общая обстановка и атмосфера в поликлинике играют важную роль для...

Анализы для животных – необходимость или блажь?

16-02-2017

Необходимость сдачи собственных анализов при каком-либо заболевании не вызывает у...

Отоскопия и лечение среднего отита

01-02-2017

Придя к врачу, пациент обязательно подвергается стандартной процедуре обследования. Оно...

Хвойные ванны – польза да и только

15-01-2017

Уже не одно столетие человечество использует полезные свойства водных процедур...

Оборудование Б/У по специальным ценам!

 

Секвенатор ДНК Pyromark Q24

Секвенатор ДНК Pyromark Q24
1453254432.jpg

Области применения:
    клинические и научные исследования;
    детектирование генетических полиморфизмов;
    мониторинг и выявление соматических мутаций при развитии онкологических заболеваний;
    эпигенетические исследования (анализ статуса метилирования);
    обнаружение единичных однонуклеотидных замен, вставок и делеций (SNP), исследование и анализ редких мутаций;
    количественный анализ частот аллельной встречаемости.
PyroMark Q24 — компактен, прост в обращении и сервисном обслуживании.

Некоторые задачи генетического анализа:
    расшифровка абсолютно неизвестных последовательностей ДНК, например, генома какого-нибудь нового вида (секвенирование «de novo»);
    обнаружение индивидуальных отличий конкретного образца от обобщенной последовательности, которая в общих чертах уже известна (ресеквенирование);
    анализ генетических полиморфизмов, включая однонуклеотидные (SNP-типирование);
    анализ эпигенетических модификаций ДНК, например профиля метилирования;
    анализ профиля экспрессии отдельных клеток секвенированием к ДНК, полученной из тотальной мРНК клетки, например, для диагностики вирусных и раковых заболеваний и др.

Методы секвенирования.
«Классический» метод Сэнгера.
Метод секвенирования НК путем «обрыва цепи» (Ф.Сэнгер) основан на синтезе новой ДНК-цепи на анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера и смеси дезоксинуклеотидтрифосфатов (dATP, dGTP, dCTP, dTTP) и на случайном обрыве синтезируемой цепи при встраивании одного из меченных разными флуоресцентными красителями дидезоксинуклеотидов (ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP). Поскольку «обрыв цепи» происходит статистически, то получается весь набор ДНК-фрагментов, отличающихся между собой по длине всего на один нуклеотид. Затем полученная смесь ДНК-фрагментов обрабатывается формамидом для расхождения цепей и подвергается капиллярному электрофорезу в полиакриламидном геле, в результате чего фрагменты распределяются по длине. Сканирование лазером, возбуждающим флуоресценцию красителей, которыми были помечены дидезоксинуклеотидфосфаты, позволяет определить последовательность нуклеотидов исходной молекулы НК.
Метод пиросеквенирования.
Метод секвенирования НК (П. Ниреном) основан на синтезе новой ДНК-цепи на иммобилизированной анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера при последовательном добавлении каждого дезоксинуклеотидтрифосфата (dATP, dGTP, dCTP, dTTP). При встраивании нуклеотида стехиометрически высвобождается пирофосфат (PPi). Пирофосфат (PPi) ферментом ATP-сульфурилазой в присутствии аденозин-5’-фосфосульфата (dATPαS) превращается в ATP, которая является «топливом» для фермента люциферазы, превращающей люциферин в оксилюциферин с испусканием света. Свет регистрируется камерой и далее анализируется компьютерной программой. Невстроенные нуклеотиды подвергаются деградации ферментом апиразой, и реакция начинается с новым нуклеотидом.
Бисульфитный метод.
Метод для определения паттерна (профиля) метилирования ДНК основан на бисульфитной обработке ДНК, первращающей остатки цитозина в остатки урацила, но не затрагивающей метилированные остатки 5-метилцитозина. Дальнейший анализ сводится к различению однонуклеотидных полиморфизмов, и к разделению цитозинов и тиминов в прочитанных последовательностях.
Классификация генетических анализаторов.
    По гомогенности пробы:
    — гомогенная проба (очищенный раствор молекул НК, полученных из одного источника, одинаковой структуры и практически одинаковой длины) — «классические» секвенаторы;
    — негомогенная проба («библиотека» молекул НК, которые могут отличаться по длине, по структуре и могут быть получены из различных источников) — «NGS» — секвенаторы.
    По длине прочтений:
    — короткие чтения;
    — средние чтения;
    — длинные чтения.
    По используемой технологии:
    — технология по методу Сэнгера;
    — метод пиросеквенирования;
    — технология «454»;
    — технология «ionTorrent»;
    — технология «SOLiD»;
    — технология «Solexa»;
    — технология «WildFire».
    По количеству отдельных чтений за запуск.
    По количеству одновременно анализируемых образцов (мультиплексирование).
    По времени, необходимому на запуск.
    По дополнительным требованиям.
    По стоимости секвенатора.
    По стоимости одного запуска.
    По стоимости анализа отдельной пробы.
    По методам генетического анализа.
В «классических» секвенаторах для анализа используется гомогенная проба. Обычно до начала секвенирования производят амплификацию участков ДНК, последовательность которых требуется определить, при помощи ПЦР. В результате получается гомогенная проба одинаковых ДНК-фрагментов. Негомогенность исходной пробы, или ошибки в ходе ПЦР-реакции могут привести к тому, что не удастся однозначно определить генетическую структуру молекулы нуклеиновой кислоты.
Для генетического анализа 24 образцов;
короткие чтения (от 60 до 200 п.н.);
производительность за запуск, п.н. — 1,4 — 4,8×103.

 2453254432.jpg

 

 

3453254432.jpg

4453254432.jpg